Struktur kurikulum SMAN 1 Bantul Tahun Pelajaran 2017/2018 ini terdiri dari 2 program, yaitu program Sistem Kredit Semester (SKS) untuk kelas X dan sistem non SKS untuk kelas XI dan XII. Program SKS menggunakan layanan paket 4 semester dan paket 6 semester. Pola yang digunakan kontinu yaitu setiap mata pelajaran muncul dalam setiap serinya. Struktur kurikulum terdiri atas Daftar Mata Pelajaran, Pengaturan Alokasi Waktu per Mata Pelajaran, Pemanfaatan Tambahan 2 Jam per Minggu, dan Program Muatan Lokal.
1. Kompetensi Inti
Kompetensi Inti Sekolah Menengah Atas/Madrasah Aliyah (SMA/MA) merupakan tingkat kemampuan untuk mencapai Standar Kompetensi Lulusan (SKL) yang harus dimiliki seorang peserta didik SMA/MA pada setiap tingkat kelas. Kompetensi Inti dirancang untuk setiap kelas. Melalui kompetensi inti, sinkronisasi horisontal berbagai kompetensi dasar antarmata pelajaran pada kelas yang sama dapat dijaga. Selain itu sinkronisasi vertikal berbagai kompetensi dasar pada mata pelajaran yang sama pada kelas yang berbeda dapat dijaga pula.
Rumusan kompetensi inti menggunakan notasi sebagai berikut:
1. Kompetensi Inti-1 (KI-1) untuk kompetensi inti sikap spiritual;
2. Kompetensi Inti-2 (KI-2) untuk kompetensi inti sikap sosial;
3. Kompetensi Inti-3 (KI-3) untuk kompetensi inti pengetahuan; dan
4. Kompetensi Inti-4 (KI-4) untuk kompetensi inti keterampilan.
2. Mata Pelajaran
Struktur Kurikulum terdiri atas mata pelajaran umum kelompok A, mata pelajaran umum kelompok B, dan mata pelajaran peminatan akademik kelompok C. Mata pelajaran peminatan akademik kelompok C dikelompokkan atas mata pelajaran Peminatan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam dan mata pelajaran Peminatan Ilmu Pengetahuan Sosial.
Pengembangan materi pelajaran mengacu pada visi dan misi sekolah yaitu pengembangan prestasi, karakter, dan peserta didik yang berwawasan lingkungan. Materi pelajaran dikembangkan berbasis pada kegiatan pelestarian lingkungan, pencegahan pencemaran lingkungan dan kerusakan lingkungan hidup dengan mengintegrasikan dalam indikator mata pelajaran.Daftar selengkapnya tentang kelompok-kelompok mata pelajaran tercantum dalam tabel 2, 3, dan 4.